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三老爷宫开基於清康熙初期，为明郑遗臣所建祠宇，祀朱王爷（郑成功）。郑氏军队由禾寮港德庆溪（原三老爷宫前）登岸，曾驻军於此，围攻赤崁楼，致使荷兰人投降。郑氏克台後，为反清复明，奔走国事，积劳成疾，来台一年即告别人间。遗臣为崇仰且功德，乃塑造金身奉祀。 

至康熙廿二年（西元1683年）清军水师提督施琅将军征台，嗣子郑克塽降清，里民为避隐清官面目，而将国姓爷改尊奉为朱王爷，继续崇奉。乾隆十五年（西元1750年）境内三老爷街，安禄境街及鸭母寮街等里民合力捐建扩大庙宇延袭至今。